| 排名 | 成績 | 選手姓名 | 賽會名稱 | 名次 | 日期 | 地點 |
| 1 | 50.13 | 林仲威(2004) | 全國大專校院運動會 | 1 | 2023/05/10 | 中壢 |
| 2 | 50.14 | 陳 傑(1992) | 中國田徑大獎賽福州站 | 3 | 2011/06/26 | 福州 |
| 3 | 50.47 | 林進福(1979) | 世界青年盃田徑錦標賽(準決賽) | 2sf1 | 1998/07/29 | 安錫 |
| 4 | 50.49 | 余嘉軒(1995) | 亞洲青年田徑錦標賽 | 1 | 2014/06/15 | 臺北 |
| 5 | 50.77 | 陳建榮(2003) | 全國運動會 | 3 | 2021/10/20 | 板橋 |
| 6 | 51.01 | 陳天文(1978) | 臺灣區運動會 | 1 | 1996/10/26 | 屏東 |
| 7 | 51.12 | 林芝豪(1996) | 全國中等學校運動會 | 1 | 2014/04/24 | 桃園 |
| 8 | 51.33 | 吳聖傑(1994) | 全國中等學校運動會 | 1 | 2012/04/25 | 臺北 |
| 9 | 51.41 | 楊竣淳(2004) | 新北市全國青年盃田徑公開賽 | 1 | 2023/03/10 | 板橋 |
| 10 | 51.42 | 林偉祺(1994) | 全國田徑錦標賽 | 3 | 2012/10/27 | 臺北 |
| 註：成績採計對象為成績樹立該年12月31日尚未滿20歲者。（World Athletics Competition Rule 3.1） | ||||||
男子400公尺跨欄U20歷年十傑
整理：KC