| 排名 | 成績 | 選手姓名 | 賽會名稱 | 名次 | 日期 | 地點 |
| 1 | 13:58.51 | 簡子傑(2007) | 日本體育大學長距離紀錄賽 | 4 | 2024/11/30 | 橫濱 |
| 2 | 14:28.6 | 張永政(1963) | 澳洲田徑公開賽 | 6f2 | 1981/03/05 | 墨爾本 |
| 3 | 14:36.94 | 何承勳(1995) | 西方學院田徑邀請賽 | 19 | 2014/05/10 | 洛杉磯 |
| 4 | 14:44.74 | 吳文騫(1977) | 臺灣區運動會 | 3 | 1996/10/26 | 屏東 |
| 5 | 14:46.14 | 徐立紘(2005) | 臺灣國際田徑公開賽 | 5 | 2024/06/02 | 臺北 |
| 6 | 14:46.3 | 梁燕琳(1963) | 全國田徑公開賽 | 2 | 1982/08/29 | 臺北 |
| 7 | 14:47.72 | 蔣介文(1982) | 亞洲青年田徑錦標賽 | 3 | 2001/07/22 | 汶萊 |
| 8 | 14:51.3 | 林宏榮(1961) | 臺灣區運動會 | 3 | 1980/10/26 | 嘉義 |
| 9 | 14:58.77 | 李翰暄(1995) | 全國中等學校田徑錦標賽 | 1 | 2012/09/29 | 臺北 |
| 10 | 15:00.48 | 黃登顯(2001) | 全國大專校院運動會 | 2 | 2020/11/03 | 左營 |
| 註：成績採計對象為成績樹立該年12月31日尚未滿20歲者。（World Athletics Competition Rule 3.1） | ||||||
男子5000公尺U20歷年十傑
整理：KC