| 排名 | 成績 | 選手姓名 | 賽會名稱 | 名次 | 日期 | 地點 |
| 1 | 46.89 | 楊隆翔(1996) | 全國中等學校運動會 | 1 | 2015/04/27 | 板橋 |
| 2 | 46.94(手按46.8) | 王榮華(1958) | 亞洲代表權國內選拔賽 | 1 | 1977/05/12 | 臺中 |
| 3 | 46.95 | 林昭丞(2006) | 全國中等學校運動會 | 1 | 2024/04/22 | 臺北 |
| 4 | 46.98 | 王偉旭(1996) | 世界中學生運動會 | 1 | 2013/11/30 | 巴西利亞 |
| 5 | 47.04 | 林光亮(1969) | 全國田徑巡迴大獎賽 | 1 | 1988/06/05 | 基隆 |
| 6 | 47.24 | 張博智(1978) | 全國大專校院運動會 | 1 | 1997/04/28 | 民雄 |
| 6 | 47.24 | 楊登凱(1978) | 東亞運動會 | 4 | 1997/05/16 | 釜山 |
| 8 | 47.27 | 林裕民(1965) | 臺北市中正杯田徑公開賽 | 1 | 1984/09/29 | 臺北 |
| 9 | 47.31 | 劉元凱(1981) | 全國中等學校暨分齡田徑賽(預賽) | 1h | 1999/11/25 | 鳳山 |
| 10 | 47.33 | 陳 傑(1992) | 全國大專校院運動會 | 1 | 2011/05/08 | 臺中 |
| 10 | 47.33 | 陳政安(2004) | 亞洲U20田徑錦標賽 | 3 | 2023/06/04 | 醴泉 |
| 註：成績採計對象為成績樹立該年12月31日尚未滿20歲者。（World Athletics Competition Rule 3.1） | ||||||
男子400公尺U20歷年十傑
整理：KC